2024-07-19 | 来源：网络转载 | 作者：佚名

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本文主要写了flowjo 10.8.1 mac新手入门教程，每个段落介绍一个功能的使用

FlowJo 10.8.1 Mac版新手入门教程

1. 软件安装与启动

首先从FlowJo官网下载Mac版安装包，双击dmg文件后将FlowJo图标拖拽到Applications文件夹完成安装。首次启动时，系统可能会提示"无法验证开发者"，这时需要进入系统设置-安全性与隐私中点击"仍要打开"。启动后会看到简洁的欢迎界面，左侧是最近打开的项目列表，点击"New Workspace"即可创建新工作区。

2. 导入流式细胞数据

点击菜单栏"File > Import"或直接拖拽FCS格式数据文件到工作区。FlowJo支持单文件或多文件批量导入，导入后会显示样本列表。每个样本会显示基本信息如事件数、采集日期等。可以右键点击样本进行重命名或添加注释，方便后续分析时快速识别不同实验组。

3. 创建分析门(Gating)

双击样本打开图形窗口，默认显示FSC-A vs SSC-A散点图。点击工具栏"Polygon"或"Rectangle"等门工具，在图上圈选目标细胞群。创建门后可以右键选择"Rename"命名门(如"Live Cells")。通过"Hierarchy"窗口可以查看门的层级关系，拖动门可以调整分析顺序，这对复杂分析非常重要。

4. 统计与导出数据

在"Table Editor"中可以查看各门内的细胞百分比和绝对数量等统计结果。选中需要导出的数据，点击"Export"按钮可将统计表格保存为CSV或Excel格式。通过"Layout Editor"可以创建包含多个图形的报告页面，支持导出为PDF或图片格式，方便在论文或报告中展示分析结果。

5. 批处理多个样本

对于大量样本的相同分析，可以使用"Batch"功能：先对一个样本完成门设置，然后右键选择"Copy Gates"，全选其他样本后"Paste Gates"应用相同分析方案。在"Group"功能中可以将样本分组(如实验组/对照组)，便于后续比较分析。批处理完成后，可以通过"Overlay"功能将多个样本的图形叠加显示，直观比较不同组间的差异。

6. 保存与备份项目

定期点击"File > Save"保存.wsp格式的工作区文件，该文件包含所有分析设置和门信息。建议使用"File > Save As"定期创建备份版本(如添加日期后缀)。通过"Preferences"可以设置自动保存间隔。如需与他人协作，可以使用"Export Experiment"功能生成包含原始数据和分析的完整项目包。