2024-08-06 | 来源：网络转载 | 作者：佚名

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本文主要写了Discovery Studio 4.5新手入门教程，每个段落介绍一个功能的使用

Discovery Studio 4.5新手入门教程

1. 软件安装与启动

Discovery Studio 4.5是专业的分子模拟和药物设计软件。安装时请确保计算机满足最低配置要求：Windows/Linux系统、4GB以上内存。安装完成后，双击桌面图标启动软件，首次启动会提示选择工作目录，建议新建专用文件夹存放项目文件。

2. 创建第一个分子模型

在菜单栏点击"File > New > Molecule"创建新分子。可以通过三种方式构建分子：1)使用内置的分子绘制工具手动绘制；2)从蛋白质数据库(PDB)导入已有结构；3)通过SMILES字符串自动生成。新手建议从PDB导入简单蛋白质如1CRN开始练习。

3. 基本分子可视化操作

在3D视图窗口中，鼠标左键拖动可以旋转分子，右键拖动平移，滚轮缩放。通过"Display Style"菜单可以更改显示方式：线框模式、球棍模型或表面显示。"Color Scheme"选项可设置按元素、二级结构等不同方式着色。建议尝试不同显示组合观察效果。

4. 分子对接基础操作

进行分子对接前需要准备受体和配体：1)在"Prepare Protein"工具中处理受体蛋白；2)用"Prepare Ligands"准备小分子配体。然后打开"CDOCKER"模块设置对接参数，运行后可以查看对接分数和结合模式。对接结果会显示多个可能构象，分数越低表示结合越好。

5. 分析分子相互作用

对接完成后，在"Analyze"菜单中选择"Interaction Diagram"可以可视化分子间作用力。氢键显示为绿色虚线，疏水作用为紫色弧线。通过"Measurements"工具可精确测量键长、键角等参数。这些信息对理解分子识别机制非常重要。

6. 保存和导出结果

工作完成后，通过"File > Save Project"保存整个项目(.dsv格式)。如需导出特定分子，选择"File > Export"，支持PDB、Mol2等多种格式。报告功能可以自动生成包含图片和分析数据的PDF文档，非常适合用于实验记录和论文写作。

以上是Discovery Studio 4.5的基础操作指南。掌握这些功能后，可以进一步探索其高级功能如同源建模、药效团分析和分子动力学模拟等。建议新手从简单案例开始，逐步熟悉各项工具的使用方法。