2024-06-04 | 来源：网络转载 | 作者：佚名

TAG: Schrodinger Schrodinger安装教程 Schrodinger下载 Schrodinger安装包

本文主要写了Schrodinger 2021新手入门教程，每个段落介绍一个功能的使用

Schrodinger 2021新手入门教程

1. 软件安装与启动

Schrodinger 2021是一款专业的分子模拟软件，安装过程相对简单。首先从官网下载安装包，运行安装程序后按照向导提示完成安装。安装完成后，在开始菜单中找到"Schrodinger Suite 2021"程序组，点击"Maestro"图标即可启动软件主界面。首次启动时可能需要输入许可证信息。

2. 创建新项目

启动Maestro后，点击左上角的"File"菜单，选择"New Project"创建一个新项目。在弹出的对话框中输入项目名称和保存位置。建议为每个研究课题创建单独的项目文件夹，方便管理相关文件。创建完成后，工作区会显示项目面板，可以在这里查看和管理项目中的所有文件。

3. 导入分子结构

Schrodinger支持多种分子文件格式。要导入分子结构，点击"File"→"Import Structures"，选择PDB、SDF等格式的分子文件。导入后分子会显示在3D视图中。使用鼠标可以旋转、平移和缩放分子：左键旋转，中键平移，滚轮缩放。右键点击分子可以调出操作菜单。

4. 分子对接基础操作

进行分子对接是Schrodinger的常用功能。首先确保已导入受体和配体分子，然后在"Tasks"面板中找到"Docking"选项。选择"Glide"对接工具，设置对接参数如网格生成位置、对接精度等。点击"Run"开始对接计算，完成后可以在"Project Table"中查看对接结果和打分。

5. 结果分析与可视化

对接完成后，在项目面板中双击结果文件可以查看对接构象。使用"Measure"工具可以测量分子间距离、角度等参数。"Surface"功能可以显示分子表面性质。通过"Preferences"菜单可以调整显示效果，如原子颜色、键型等。分析结果可以导出为图片或报告。

6. 保存与导出数据

完成工作后，点击"File"→"Save Project"保存整个项目。如需导出特定分子结构，选中分子后点击"File"→"Export"，选择导出格式如PDB、Mol2等。计算结果和图表也可以通过"File"→"Export"导出为文本或图片格式，方便在论文或报告中使用。