2024-09-03 | 来源：网络转载 | 作者：佚名

TAG: Pymol Pymol安装教程 Pymol下载 Pymol安装包

介绍pymol2.6 开源版软件的作用、功能、用途和历史发展，开发背景，应用领域

PyMOL 2.6 开源版介绍

软件作用与功能

PyMOL 2.6是一款专业的分子可视化软件，主要用于生物大分子（如蛋白质、核酸等）的三维结构展示和分析。它能够将复杂的分子结构以3D形式呈现，支持多种渲染模式（如卡通、球棍、表面等），并允许用户进行旋转、缩放等交互操作。

主要功能包括：分子结构可视化、电子密度图显示、分子对接结果展示、动画制作、测量分子间距离/角度、结构比对等。特别适合用于科研论文配图制作和分子结构教学演示。

开发背景与历史

PyMOL最初由Warren Lyford DeLano博士于2000年开发，最初是商业软件。2010年Schrödinger公司收购了PyMOL，并在保持商业版的同时推出了开源版本。2.6版本是开源系列中的重要更新，增加了Python 3支持、改进的图形渲染引擎等新特性。

PyMOL的发展反映了结构生物学领域对可视化工具日益增长的需求。随着蛋白质结构数据库(PDB)中结构数量的爆炸式增长，科研人员需要更强大的工具来分析和展示这些结构。

主要应用领域

PyMOL广泛应用于多个科学领域：

• 结构生物学：蛋白质、核酸等生物大分子的结构分析与展示
• 药物设计：可视化药物分子与靶标蛋白的相互作用
• 生物化学教学：用于分子结构的教学演示
• 科研论文：制作高质量的分子结构示意图
• 生物信息学：结构比对和功能位点分析

作为开源软件，PyMOL 2.6特别受到学术界的欢迎，因为它既提供了专业的功能，又降低了科研成本，适合实验室日常使用。